De kosten van een unitair octrooi zijn wat het opstellen, indienen en verleend krijgen van de Europese octrooiaanvraag gelijk aan die van een “klassiek” Europees octrooi. Van een unitair octrooi dient echter na verlening een vertaling beschikbaar te worden gesteld in een EU-taal anders dan het Engels, wanneer het octrooi in het Engels is verleend, of in het Engels, wanneer het octrooi in het Frans of Duits is verleend. Deze vertaalkosten kunnen enkele honderden tot enkele duizenden euro’s bedragen, afhankelijk van de lengte van de benodigde vertaling. Hét grote verschil zit hem echter in de kosten van de jaartaksen: wanneer octrooibescherming in meer dan vier Europese landen is gewenst, is een unitair octrooi voor de vuist weg goedkoper. Vooral wanneer dit unitaire octrooi lang in stand blijft: wanneer een unitair octrooi bijvoorbeeld voor de volle 20 jaar in stand wordt gehouden in alle deelnemende EU-landen, zijn de kosten van de jaartaksen uiteindelijk zo’n 60% lager dan bij validatie van een “klassiek” Europees octrooi in deze EU-landen (een verschil van al gauw enkele duizenden tot tienduizenden euro’s).